生物安全实验室主要是为了避免在微生物和医学实验室中进行各种有危害或有潜在危害的生物因子活动过程中，可能对人、环境和社会造成危害或潜在危害，而采取的防护措施和管理措施，达到对人、环境和社会的安全防护目的。
生物安全实验室基础要求
1、在建造生物安全防护实验室前，要明确划分出一实验区域，限制实验人员以外的人靠近该地区。
2、生物实验室区域之入口设有缓冲室，其前后二个门不能同时开启。而且应有更衣室及沐浴室设备。
3、将实验材料及其它物品搬入生物实验室区域时，不可经过人员出入之缓冲室及更衣室，必需另经由有紫外线照射之缓冲室。
4、生物安全防护实验室的地面、墙壁及天花板，应具有容易清洗、能够熏蒸，及防止昆虫及鼠类等侵入之结构。让实验区域处于适当的封闭情况，但这并不表示一定要密闭。
5、实验区域之大门，需能自动开关，并可上锁。
6、生物安全防护实验室设置中央真空系统时，在尽量就近各使用场所配置实验区域专用之HEPA过滤器。HEPA过滤器，应不需移动就可灭菌，并且可以改换。
7、应用实验区域水及瓦斯之配管，需有防止逆流的装置。
8、实验区搬出的物品，必需先经过高压、浸渍或熏蒸灭菌处理。灭菌设备为通过式且两边门不能同时开启。
9、生物安全防护实验室区域需有专用之空调装置。这个装置需为负压，空气从外面流入时，要设计逐渐往危险性高的区域流，同时要维持其压力差，并且防止空气逆流。而且需有告知错误情况发生的警报装置。
10、生物实验室内排出的气体，需经过HEPA过滤器过滤，并避免其向附近建筑物之空气进口处扩散。所装置之HEPA过滤器，需在不移动的情况下，就可灭菌，而且更换之后立刻做其性能检查。
11、三级安全操作装置处理之后的废气需往户外排出。如果这些废气必需通过实验区域专用的排气装置排出时，不可扰乱安全操作装置，或实验区域排气系统的空气平衡。
12、实验区域内需具备两套以上之发电设备，以使在电力供给不足时，可维持负压状态。
13、实验区域内需有废水收集及灭菌之设备。