目前垃圾焚烧发电厂渗滤液处理主要采用  “物化+厌氧+好氧+膜处理”工艺，分为前段生化处理系统和后段膜处理系统。由于因工程初期投资及运行成本的限制，大多数垃圾焚烧发电厂的渗滤液处理系统达不到实际需要的处理能力。实际建设和运行主要存在以下问题：
1.生化处理系统的调试运行周期较长，一般为3～6个月。调试期和处理能力受环境及电厂运行状况影响较大，往往不能在短时间内及时处理，导致渗滤液处理系统很难与电厂同步运行，给电厂验收及投产造成影响。
2.膜处理系统因受到膜处理水平的限制，产水垃圾焚烧发电厂渗滤液回喷新工艺的应用率不高，有20%～30%的浓水产生。这些浓水不能直排，无法回用，又不能直接回喷到焚烧炉内(热值不够高)，这些原因导致发电厂在渗滤液处理方面面临的困难。
3.生化处理系统设备数量较多，运行维护困难，运行环境差。膜处理系统因水质较差，膜使用寿命普遍较低，费用较高，产水量不稳定。目前生化处理系统所使用的设备还存在一定的技术难题尚未解决，个别设备不能完全满足使用条件的要求，寿命大大缩短，增加了运行及设备维护成本。